Administration af havne I 2001 blev Statshavnsadministrationerne i henholdvis Esbjerg og Frederikshavn (SHAEF) nedlagt. Kystdirektoratet, KDI, overtog administrationen af Helsingør Statshavn, Thorsminde Statshavn og sluse, sluserne i Hvide Sande og Statens Uddybningsmateriel (STU). De andre havne blev overdraget til deres respektive kommuner.
Helsingør Statshavn inklusive medarbejdere blev pr. den 1. januar 2005 overdraget til Helsingør Kommune. Det betyder at den eneste tilbageværende statshavn i Danmark er Thorsminde Havn, der ligger midt på den jyske vestkyst, ca. 25 kilomter syd for Lemvig.
Andre havneopgaver Ved overdragelsen af de tidligere statshavne blev det aftalt, at staten, ved KDI, fortsat skulle varetage en række opgaver med oprensning af sejlløb og bassiner og vedligeholdelse af moler m.m. i flere af havnene.
